他亲自钻老林，采摘各种草根、树皮、种子、果实；捕捉各种飞禽走兽、鱼鳖虾虫；挖掘各种石头矿物，一样一样地亲口尝。
观察体会它们在身子里各走哪一经，各是何性，各治何病。
可哪一味都只在十二经脉里打圈圈，长此以往，神农就制定了人体的十二经脉和《本草经》。
这一天，他忽然发现一株攀在树上的藤状植物，开着一朵朵黄色的小花，那叶子还会一张一缩，他奇怪极了，就采了一些叶子放在嘴里咀嚼着。
谁知这是一种有剧烈毒性的药草，唤作断肠草，服之肠穿肚烂。
神农发觉自己中毒，却也并不担心，以前辨识草药时，也经常中毒，不过却因曾得一片灵茶之叶，口含便可化解百毒。
只可惜，这一次断肠草毒竟是不能解，就在他神志恍惚，渐渐进入弥留之际，一朵祥云落于身前，模模糊糊中看到来人仿佛是八景宫玄都师兄。
玄都走到他的身前，叹息一声，取出了一枚金丹塞入了神农的口中，断肠之毒瞬间化去，神农立即恢复了神志，起身谢过了玄都的救命之恩。
玄都又赠了他一葫芦救命金丹之后，便取出了一条红色的鞭子，言道此鞭名为赭鞭，为太清道人亲手所炼，特来送与神农助他一臂之力。
之后，神农以赭鞭鞭百草，尽知其平毒寒温之性，详尽地了解草木是有毒还是无毒，是凉性还是温性……
神农一边忙于人族政务，还要辨识百草，编纂本草经，忙碌之余，不免忽视了家人。
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